地理标志产品保护申请主体与申请程序为：①当地县级以上人民政府指定的地理标志产品保护申请机构或人民政府认定的协会提出地理标志产品保护申请，并征求相关部门意见。②地理标志产品的保护申请向省级知识产权管理部门报送。③省级知识产权管理部门按照分工，负责对拟申报的地理标志产品的保护申请提出初审意见，并将相关文件、资料上报国家知识产权局。④申请经国家知识产权局审查合格注册登记后，发布核准公告，生产者即可在其产品上使用地理标志保护产品专用标志，获得地理标志产品保护。