题目考点分析：本题考查的是环孢素这一免疫抑制剂的主要不良反应。环孢素是一种常用的抗排斥药物，常用于器官移植后防止排异反应，其药理作用机制与抑制T细胞活性有关，但同时也可能对身体多个系统产生副作用。

正确答案的理由：环孢素的主要不良反应是肝肾损害。该药主要通过肝脏代谢，经肾脏排泄，长期使用容易导致肝功能异常和肾功能损伤，因此在临床应用中需密切监测肝肾功能。

其他选项错误的原因：心律失常（A）不是环孢素的典型不良反应；胃肠反应（B）虽然可能出现，但并非最常见或最严重；中枢症状（C）如震颤、失眠等也较为少见；过敏反应（D）虽有可能发生，但不如肝肾损害常见和重要。因此，E选项为最佳答案。