关节结核是一种慢性炎症性疾病，主要由结核分枝杆菌感染引起。其病理过程通常始于滑膜，导致滑膜增生、充血和渗出。随着病情进展，结核性肉芽组织会侵蚀关节软骨和软骨下骨。关节结核的关节面破坏首先发生在关节非持重部分，尤其是滑膜附着处。这是因为滑膜是结核杆菌最先侵袭的部位，滑膜的炎症反应和肉芽组织的形成会逐渐破坏邻近的关节软骨和骨组织。选项A、B和C涉及骨骺、干骺端和骨骺板，这些部位在结核感染的早期阶段通常不受影响。选项E描述的关节承重部位和对称性破坏是晚期病变的表现，不是最初的破坏部位。因此，关节结核的关节面破坏首先发生在关节非持重部分，滑膜附着处，即选项D.