注册会计师专业阶段考试免试申请流程如下：

填写申请表：符合免试条件的人员需填写《注册会计师全国统一考试专业阶段考试科目免试申请表》。填写时要确保信息准确无误，包括个人基本信息、高级技术职称或境外相关考试合格等情况，以及拟申请免试的科目等。

准备申请材料

国内高级职称人员：需提供身份证件复印件、高级技术职称证书及批准文件复印件。若高级技术职称批准文件中的单位与现在所在单位不一致，还需原单位或者现单位出具情况说明。

境外互惠豁免人员：需提交豁免申请表、符合豁免条件的考试合格证明复印件、身份证件复印件、会员证书复印件、近期标准护照照片。

提交申请：将填写好的申请表及相关材料提交给地方考办。需注意，各地区的提交方式和时间可能有所不同，有些地区可能要求现场提交，有些地区可能支持线上提交，要关注当地注协或考办的具体通知。

地方考办审核

材料审查：地方考办会严格审查高级技术职称证书的真实性，以及境外考试合格证明等材料的有效性。

资格界定：准确界定免试年度、免试科目，免试年度应当为应考人员提交申请的年度，并不得早于高级技术职称的批准年度。

制作上报文件：地方考办在审核无误后，会制作上报文件，上报文件包括地方考办关于考生申请免试的请示、免试申请汇总表、免试申请表、高级技术职称证书复印件和批准文件复印件、身份证件复印件等，并在申请表的 “地方考办意见” 栏内签署意见并加盖公章，同时根据注册会计师考试管理信息系统中免试管理模块上传电子数据。

财政部考办审核批复：财政部考办负责对地方考办上报的文件进行审核，在审核无误后 1 个月内予以正式批复。对于境外互惠豁免申请，财政部考办也会在收到豁免申请后 1 个月内审核确认，并以中注协名义制发部分考试科目豁免通知书。