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细菌根据其能源和碳源的利用方式分为自养菌和异养菌两大营养类型。异养菌又可细分为腐生菌和寄生菌。腐生菌以动植物尸体、腐败食物等为营养物。寄生菌则寄生于活体内，从宿主体内的有机物中获取营养。需要注意的是，所有的病原菌皆属于异养菌，其中大部分为寄生菌。