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免疫磁珠细胞分析磁珠大小可以选择，0.06~10μm不等。大磁珠对细胞造成机械压力，影响其生物学活性，不利于分离后培养；可阻塞流式细胞仪的喷嘴，影响散射光。但其技术简单，分离可在试管中完成。收率较高，纯度较低。