执业医师资格证书的注册流程如下：

电子化注册

注册账户：登录国家卫生健康委电子化注册信息系统（https://gjdzhzc.nhc.gov.cn:8080/ndr/index.jsp），选择个人端入口，点击 “注册新账号”，按照提示填写姓名、身份证号、手机号等信息完成注册。

激活账户：注册成功后，登录系统，在 “业务申请” 中点击 “医师电子化注册”，通过输入激活码或短信验证等方式激活账户。激活码一般由所在的医疗、预防、保健机构发放。

填写信息与提交：在系统中填写个人基本信息、执业范围、执业机构等相关内容，并上传个人小二寸白底免冠正面照片，确认无误后提交注册申请。

机构审核

医疗机构操作：所在的医疗、预防、保健机构登录医师电子化注册信息系统的机构端，对医师提交的注册申请进行审核，确认信息无误后点击审核通过，并打印《医师执业、变更执业、多机构备案申请审核表》，加盖机构公章。

卫生健康部门审批

提交纸质材料：申请人将纸质材料提交至当地卫生健康行政部门或其指定的政务服务窗口。材料一般包括《医师执业、变更执业、多机构备案申请审核表》、身份证复印件、医师资格证书复印件、在二级以上医院 6 个月内的《医师注册健康体检表》、医疗、预防、保健机构的聘用证明、正面免冠白底彩色小 2 寸近照等。

审核与发证：卫生健康行政部门对提交的材料进行审核，审核时间一般为 20 个工作日。审核通过的，予以注册，发放《医师执业证书》；审核不通过的，会书面通知申请人并说明理由